La vaccinazione è un pilastro della sanità bovina, sia per gli allevamenti da latte che da carne. In Italia sono attivi piani regionali di eradicazione per IBR (Rinotracheite Infettiva Bovina) e BVD (Diarrea Virale Bovina) che prevedono l'uso strategico di vaccini marker. Le clostridiosi (enterotossiemia, carbonchio sintomatico) sono prevenibili con vaccinazione e causano morte improvvisa. Il piano vaccinale è personalizzato per ogni allevamento dal veterinario aziendale.