La vaccinazione è fondamentale per il furetto domestico. Il cimurro canino (CDV) è letale nel 100% dei casi nel furetto non vaccinato — non esiste terapia efficace una volta contratta la malattia. La rabbia è l'altro vaccino raccomandato (e obbligatorio in alcune regioni e per l'espatrio). Il furetto ha una peculiarità importante: il rischio di reazione anafilattica post-vaccinale è più alto rispetto a cane e gatto, per cui il veterinario tiene in osservazione il furetto per almeno 30 minuti dopo la vaccinazione.